2023.12.20

qPCRソフトウェアの設定方法：土壌伝染性寄生虫解析のために

marugotoyoten

インペリアル・カレッジ・ロンドンのYoutube動画「qPCRソフトウェアの設定方法：土壌伝染性寄生虫解析のために」について要点と要約をまとめました

３つの要点

要点１
qPCRソフトウェアの設定方法
要点２
プレートの設定とサンプルの割り当て
要点３
結果の解析とデータのエクスポート

要約

ソフトウェアと実験の詳細の設定
このビデオでは、スツール抽出物中の土壌伝染性寄生虫の解析のために、Step One Plus装置でqPCRソフトウェアの設定方法を案内します。DNA標準の割り当て、実験名の設定、適切な装置とプラットフォームの選択のプロセスを説明します。プロジェクト名、アッセイ名、サンプル番号、およびあなたの名前を含めることは、より良い組織化のために重要です。

プレートの設定とサンプルの割り当て
ソフトウェアの設定が完了したら、プレートの設定に移ります。アッセイ名とレポーターを含む、ターゲットとサンプルを定義します。コントロールサンプルでは、FAMを染料として、クエンチャーとしてはなしを使用します。サンプル、DNA標準の濃度、および非テンプレートコントロールは手動で割り当てますが、サンプルの順序を自動的に読み込む方法もあります。標準は5点と3つのレプリカで定義され、ソフトウェアが自動的に量を調整します。

実行方法の調整と設定の保存
プレートの設定が完了したら、反応の体積とサイクリングステージの温度を調整する必要があります。将来の使用のために、全体の設定をテンプレートまたはEDTファイルとして保存しますが、必要に応じて実行の名前とターゲットの仕様を変更することを忘れないでください。進行する前に実行を保存することは重要です。解析を開始するには、実行ボタンを押します。

結果の解析とデータのエクスポート
実行が完了したら、解析タブから結果を解析することができます。増幅プロット、標準曲線、マルチコンポーネントプロット、およびQCサマリーを確認できます。標準曲線の効率は90〜110の間である必要があり、抑制がなく、製品が各サイクルで2倍に増えていることを示しています。結果はxls形式でエクスポートし、ファイルを保存することができます。

▼今回の動画